蹂躙し尽された人類。焦土と化した東京で、生き残ったガンツメンバーはそれぞれの戦いを開始する。ガンツ部屋に戻り、打開のヒントを得ようとするもう一人の玄野たち。一方、敵巨大戦艦に囚われた多恵を追う玄野は内部の人間たちを救うためにただ一人孤独な戦いを開始する。絶望的な戦いの先に光明はあるのか。被虐と加虐が曖昧になる反逆の章、ついに開始!?